Klitmøller friskole tilbyder undervisning inden for følgende fagrække, der er nærmere beskrevet i det følgende:
Humanistiske fag:
- Dansk på 0.–6. klassetrin
- Engelsk på 1.–6. klassetrin
- Tysk på 5.–6. klassetrin
- Historie 3.-6. klassetrin
- Fortælling på 0.–6. klassetrin (omfatter fagområder fra fagene dansk, historie, kristendomskundskab, musik, billedkunst, biologi, geografi, matematik og kulturhistorie)
Naturfag:
- Matematik på 0.–6. klassetrin
- Natur/teknik på 0.–6. klassetrin
- Geografi på 0.–6. klassetrin
- Biologi på 0.–6. klassetrin
Praktisk/musiske fag:
- Idræt/svømning på 0.–6. klassetrin/Haw 4.-6. klassetrin
- Krea på 0.-6. klassetrin (omfatter fagene billedkunst, håndarbejde, sløjd og hjemkundskab)
- Sang/Musik på 0.–6. klassetrin
Projektdag:
Planlægges og etableres i skoleårets slutning for skolens næste halve skoleår på 0. – 6. klassetrin. Sidste del af planlægningen skal afsluttes inden det første halve år er gået. Projektdagen skal indeholde flg. fag: dansk, matematik, billedkunst, håndværk/design, natur/teknik, musik, idræt, it, og religion.
Obligatoriske emner:
Færdselslære.
Sundheds- og seksualundervisning samt familiekundskab er knyttet til natur/teknik og biologi, men kan foretages af hvilken som helst lærer.
Teater/musical, førstehjælp indlægges i emneugerne.